1、貨物運輸安全。集裝箱運輸大大減少了傳統運輸方式中人力裝卸、搬運的次數，這就可以避免人為和自然因素造成的貨物破損、濕損、丟失等貨運事故，減少經濟損失。
2、節省貨物包裝材料。使用集裝箱運輸，可以簡化或不用運輸包裝，節省包裝材料和費用，降低商品的成本。
3、簡化貨運作業手續。貨物采用集裝箱運輸后，以箱作為貨物的運輸單元，減少了繁雜的作業環節，簡化了貨運作業手續。
4、提高裝卸作業效率。由于集裝箱的裝卸作業適于機械化，其裝卸作業效率得到了大幅度的提高。同時，大大縮短了集裝箱的站（港）的停留時間，加速了車船的周轉和貨物的送達。
5、減少運營費用，降低運輸成本。貨損、貨差大為減少，貨物保險費也隨之下降；開展“門到門”運輸業務后，可大量節省倉庫的建造費用和倉庫作業費用等。
6、便于自動化管理。集裝箱是一種規格化貨物運輸單元，這就為自動化管理創造了便利條件。

減少營運費用，降低運輸成本，由于集裝箱的裝卸基本上不受惡劣氣候的影響，船舶非生產性停泊時間縮短，又由于裝卸，裝卸時間縮短，對船公司而言，可提高航行率，降低船舶運輸成本，對港口而言，可以提高泊位通過能力，從而提高吞吐量，增加收入。

集裝箱運輸中的港口的投資也相當大。集裝箱泊位的碼頭設施包括碼頭岸線和、貨場、貨運站、維修車間、控制塔、門房，以及集裝箱裝卸機械等，耗資。

由于集裝箱運輸在不同運輸方式之間換裝時，勿需搬運箱內貨物而只需換裝集裝箱，這就提高了換裝作業效率，適于不同運輸方式之間的聯合運輸。在換裝轉運時，海關及有關監管單位只需加封或驗封轉關放行，從而提高了運輸效率。

是指在發站裝運之前各項貨運作業，包括集裝箱承運前的組織工作和承運后至裝運前的作業。具體包括貨主要明確使用集裝箱運輸的條件及有關規定，如在的集裝箱辦理站，按：站內規定承運日期辦理：辦理站受理、審核、裝箱等。

是指裝運集裝箱的貨車到貨場后需要辦理的卸車和向貨主辦理交付手續等工作，具體包括卸車作業，交付作業，鐵路貨運員根據車站的卸車計劃及時安排貨位、核對運單、貨票、裝載清單與集裝箱箱號、印封號是否一致、需要逐箱檢查，卸車；完畢后填寫到達記錄/后，由貨運室通知發貨人。門到門的集裝箱由鐵路貨運員與收貨人代理共同核對箱號，檢查箱體封印，確認無誤后，填發門到門運輸作業單，并在作業單上簽收。